dialign-tx

Source: dialign-t
Package: dialign-tx
Versions: dialign-tx (1.0.2-10), dialign-tx (1.0.2-11), dialign-tx (1.0.2-12), dialign-tx (1.0.2-13), dialign-tx (1.0.2-14), dialign-tx (1.0.2-14+b1), dialign-tx (1.0.2-15), dialign-tx (1.0.2-15+b1), dialign-tx (1.0.2-15+b2), dialign-tx (1.0.2-2), dialign-tx (1.0.2-3), dialign-tx (1.0.2-4), dialign-tx (1.0.2-5), dialign-tx (1.0.2-6), dialign-tx (1.0.2-7), dialign-tx (1.0.2-7+b1), dialign-tx (1.0.2-8), dialign-tx (1.0.2-9)
Prioritize: 48
Description: Segment-based multiple sequence alignment
 DIALIGN-TX is a command line tool to perform multiple alignment of protein or
 DNA sequences. It is a complete reimplementation of the segment-base approach
 including several new improvements and heuristics that significantly enhance
 the quality of the output alignments compared to DIALIGN 2.2 and DIALIGN-T.
 For pairwise alignment, DIALIGN-TX uses a fragment-chaining algorithm that
 favours chains of low-scoring local alignments over isolated high-scoring
 fragments. For multiple alignment, DIALIGN-TX uses an improved greedy
 procedure that is less sensitive to spurious local sequence similarities.

Description-pt_BR: alinhador de seqüências múltiplas baseado em segmentos
 DIALIGN-TX é uma ferramenta em linha de comando para realizar alinhamento
 múltiplo de proteínas ou seqüências de DNA. Ele é uma reimplementação
 completa da abordagem baseada em segmentos incluindo várias novas melhorias
 e heurísticas que aumenta significativamente a qualidade dos alinhamentos
 retornados comparado com DIALIGN 2.2 e DIALIGN-T. Para alinhamento aos
 pares, DIALIGN-TX usa um algoritmo de cadeias de segmentos que favorece
 cadeias de alinhamentos locais de baixa pontuação em detrimento de
 fragmentos isolados de alta pontuação. Para alinhamentos múltiplos,
 DIALIGN-TX usa um procedimento voraz (greedy) melhorado que é menos
 sensível a similaridades de seqüências locais falsas.

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