dialign-tx

Source: dialign-t
Package: dialign-tx
Versions: dialign-tx (1.0.2-10), dialign-tx (1.0.2-11), dialign-tx (1.0.2-12), dialign-tx (1.0.2-13), dialign-tx (1.0.2-14), dialign-tx (1.0.2-14+b1), dialign-tx (1.0.2-15), dialign-tx (1.0.2-15+b1), dialign-tx (1.0.2-15+b2), dialign-tx (1.0.2-2), dialign-tx (1.0.2-3), dialign-tx (1.0.2-4), dialign-tx (1.0.2-5), dialign-tx (1.0.2-6), dialign-tx (1.0.2-7), dialign-tx (1.0.2-7+b1), dialign-tx (1.0.2-8), dialign-tx (1.0.2-9)
Prioritize: 48
Description: Segment-based multiple sequence alignment
 DIALIGN-TX is a command line tool to perform multiple alignment of protein or
 DNA sequences. It is a complete reimplementation of the segment-base approach
 including several new improvements and heuristics that significantly enhance
 the quality of the output alignments compared to DIALIGN 2.2 and DIALIGN-T.
 For pairwise alignment, DIALIGN-TX uses a fragment-chaining algorithm that
 favours chains of low-scoring local alignments over isolated high-scoring
 fragments. For multiple alignment, DIALIGN-TX uses an improved greedy
 procedure that is less sensitive to spurious local sequence similarities.

Description-pl: Dopasowanie wielu sekwencji w oparciu o segmenty
 DIALIGN-TX to narzędzie wiersza poleceń, umożliwiające wykonywanie
 wielokrotnych dopasowań sekwencji białek lub DNA. Jest to kompleksowa
 reimplementacja podejścia bazującego na segmentach, obejmująca kilka
 nowych ulepszeń i heurystyk, które znacząco poprawiają jakość wyrównań
 wyjściowych w porównaniu z DIALIGN 2.2 i DIALIGN-T. W przypadku
 wyrównywania parami DIALIGN-TX wykorzystuje algorytm łączenia fragmentów
 w łańcuchy, który faworyzuje łańcuchy lokalnych dopasowań o niskiej
 punktacji względem izolowanych fragmentów o wysokiej punktacji. W
 przypadku wielokrotnego dopasowania DIALIGN-TX wykorzystuje ulepszoną
 procedurę "greedy", która jest mniej wrażliwa na fałszywe podobieństwa
 lokalnych sekwencji.

332158c4249267a46d8e2fc2e3aea014 translated
70e8f58c8708166b1905dd108cc31c35 translated