dialign-t

Source: dialign-t
Package: dialign-t
Versions: 
Prioritize: 48
Description: Segment-based multiple sequence alignment
 DIALIGN-T is a command line tool to perform multiple alignment of protein or
 DNA sequences. It is a complete reimplementation of the segment-base approach
 including several new improvements and heuristics that significantly enhance
 the quality of the output alignments compared to DIALIGN 2.2. For pairwise
 alignment, DIALIGN-T uses a fragment-chaining algorithm that favours chains of
 low-scoring local alignments over isolated high-scoring fragments. For
 multiple alignment, DIALIGN-T uses an improved greedy procedure that is less
 sensitive to spurious local sequence similarities.
 .
 DIALIGN-T has been published in Amarendran R. Subramanian, Jan Weyer-Menkhoff,
 Michael Kaufmann, Burkhard Morgenstern: DIALIGN-T: An improved algorithm for
 segment-based multiple sequence alignment. BMC Bioinformatics 2005, 6:66.

Description-de: Segment-basierte multiple Sequenzalignments
 DIALIGN-T ist ein Kommandozeilenwerkzeug für multiple Alignments von
 Protein- oder DNA-Sequenzen. Es ist eine komplette Reimplementierung des
 Segment-basierten Ansatzes, inklusive einiger Verbesserungen und
 Heuristiken, die die Qualität der ausgegebenen Alignments im Vergleich zu
 DIALIGN 2.2 signifikant verbessern. Für paarweise Alignments benutzt
 DIALIGN-T einen Fragment-Chaining-Algorithmus, der Ketten von
 niederwertigen lokalen Alignments vor isolierten hochwertigen Fragmenten
 bevorzugt. Für multiple Alignments benutzt DIALIGN-T eine verbesserte
 gierige Prozedur, die weniger empfindlich gegenüber störenden lokalen
 Sequenzähnlichkeiten ist.
 .
 DIALIGN-T wurde veröffentlicht in Amarendran R. Subramanian, Jan
 Weyer-Menkhoff, Michael Kaufmann, Burkhard Morgenstern: DIALIGN-T: An
 improved algorithm for segment-based multiple sequence alignment. BMC
 Bioinformatics 2005, 6:66.

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