# Source: dialign-t
# Package: dialign-t
# Versions: 
# This Description is owned
# Prioritize: 48
Description: Segment-based multiple sequence alignment
 DIALIGN-T is a command line tool to perform multiple alignment of protein or
 DNA sequences. It is a complete reimplementation of the segment-base approach
 including several new improvements and heuristics that significantly enhance
 the quality of the output alignments compared to DIALIGN 2.2. For pairwise
 alignment, DIALIGN-T uses a fragment-chaining algorithm that favours chains of
 low-scoring local alignments over isolated high-scoring fragments. For
 multiple alignment, DIALIGN-T uses an improved greedy procedure that is less
 sensitive to spurious local sequence similarities.
 .
 DIALIGN-T has been published in Amarendran R. Subramanian, Jan Weyer-Menkhoff,
 Michael Kaufmann, Burkhard Morgenstern: DIALIGN-T: An improved algorithm for
 segment-based multiple sequence alignment. BMC Bioinformatics 2005, 6:66.
Description-ja: セグメントベースの多重配列アライメント
 DIALIGN-T は、タンパク質配列または DNA 配列のマルチプルアライメントを実行す
 るためのコマンドラインツールです。これはセグメントベースのアプローチによる
 完全な再実装で、いくつかの新しい改良と DIALIGN 2.2 に比べて出力アライメント
 の品質を大きく向上したヒューリスティックを含んでいます。ペアワイズアライメント
 において、DIALIGN-T はフラグメント連鎖アルゴリズムを利用します。これは、
 孤立した高スコアのフラグメントよりも低スコアでもローカルアライメントの連鎖
 をより高く評価するアルゴリズムです。マルチプルアライメントにおいては、
 DIALIGN-T は偽の局所的な配列類似性に対して鈍感になるよう改良された貪欲法を
 利用します。
 .
 DIALIGN-T は下記において公開されました。
 Amarendran R. Subramanian、Jan Weyer-Menkhoff、Michael Kaufmann、Burkhard
 Morgenstern: DIALIGN-T: An improved algorithm for segment-based multiple
 sequence alignment. BMC Bioinformatics 2005, 6:66.

# other Descriptions of the dialign-t package with a translation in ja:
#