# Source: dialign-t # Package: dialign-t # Versions: # This Description is owned # Prioritize: 48 Description: Segment-based multiple sequence alignment DIALIGN-T is a command line tool to perform multiple alignment of protein or DNA sequences. It is a complete reimplementation of the segment-base approach including several new improvements and heuristics that significantly enhance the quality of the output alignments compared to DIALIGN 2.2. For pairwise alignment, DIALIGN-T uses a fragment-chaining algorithm that favours chains of low-scoring local alignments over isolated high-scoring fragments. For multiple alignment, DIALIGN-T uses an improved greedy procedure that is less sensitive to spurious local sequence similarities. . DIALIGN-T has been published in Amarendran R. Subramanian, Jan Weyer-Menkhoff, Michael Kaufmann, Burkhard Morgenstern: DIALIGN-T: An improved algorithm for segment-based multiple sequence alignment. BMC Bioinformatics 2005, 6:66. Description-cs: Segmentové uspořádání násobných sekvencí DIALIGN-T je nástroj příkazové řádky, který provede vícenásobná uspořádání proteinových sekvencí DNA. Jedná se o kompletní novou implementaci včetně různých vylepšení a heuristiky, která významně zvyšuje kvalitu výstupního uspořádání (oproti DIALIGN 2.2). Pro párové uspořádání, DIALIGN-T používá algoritmus spojování částí, který napomáhá tomu správnému uspořádání místních seskupení díky zavedení nízko a vysoko ohodnocených izolovaných částí. Pro vícenásobná uspořádání, DIALIGN-T používá vylepšené hladové procedury, která je méně vnímavá na nelegitimní podobnosti místních sekvencí. . DIALIGN-T vydal: Amarendran R. Subramanian, Jan Weyer-Menkhoff, Michael Kaufmann, Burkhard Morgenstern: DIALIGN-T: An improved algorithm for segment-based multiple sequence alignment. BMC Bioinformatics 2005, 6:66. # other Descriptions of the dialign-t package with a translation in cs: #