fastqtl

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Description: Quantitative Trait Loci (QTL) mapper in cis for molecular phenotypes
 The goal of FastQTL is to identify single-nucleotide polymorphisms (SNPs)
 which are significantly associated with various molecular phenotypes
 (i.e. expression of known genes, cytosine methylation levels, etc).
 It performs scans for all possible phenotype-variant pairs in cis
 (i.e. variants located within a specific window around a phenotype).
 FastQTL implements a new permutation scheme (Beta approximation) to accurately
 and rapidly correct for multiple-testing at both the genotype and phenotype
 levels.

Description-it: mappatore Quantitative Trait Loci (QTL) in cis per fenotipi molecolari
 L'obiettivo di FastQTL è di identificare polimorfismi a nucleotide singolo
 (SNP) che sono associati in maniera significativa a vari fenotipi molecolari
 (cioè espressioni di geni conosciuti, livelli di metilazione della
 citosina, ecc.). Esegue scansioni per tutte le possibili coppie
 fenotipo-variante in cis (cioè varianti localizzate all'interno di una
 finestra specifica intorno a un fenotipo). FastQTL implementa un nuovo
 schema di permutazione (approssimazione Beta) per correggere accuratamente
 e velocemente test multipli sia a livello di genotipo sia di fenotipo.

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