# Source: dialign-t # Package: dialign-tx-data # Versions: dialign-tx-data (1.0.2-10), dialign-tx-data (1.0.2-11), dialign-tx-data (1.0.2-12), dialign-tx-data (1.0.2-13), dialign-tx-data (1.0.2-14), dialign-tx-data (1.0.2-15), dialign-tx-data (1.0.2-3), dialign-tx-data (1.0.2-4), dialign-tx-data (1.0.2-5), dialign-tx-data (1.0.2-6), dialign-tx-data (1.0.2-7), dialign-tx-data (1.0.2-8), dialign-tx-data (1.0.2-9) # This Description is active # Prioritize: 48 Description: Segment-based multiple sequence alignment (data files) DIALIGN-TX is a command line tool to perform multiple alignment of protein or DNA sequences. It is a complete reimplementation of the segment-base approach including several new improvements and heuristics that significantly enhance the quality of the output alignments compared to DIALIGN 2.2 and DIALIGN-T. For pairwise alignment, DIALIGN-TX uses a fragment-chaining algorithm that favours chains of low-scoring local alignments over isolated high-scoring fragments. For multiple alignment, DIALIGN-TX uses an improved greedy procedure that is less sensitive to spurious local sequence similarities. . This package contain the score matrices and probability distribution files that DIALIGN-TX needs to align peptidic and nucleic sequences. Description-cs: DIALIGN-TX je nástroj pro příkazovou řádku umožňující provádět alignmenty několika proteinových nebo DNA sekvencí. Je to úplně přepsaná implementace segmentového přístupu s několika vylepšeními a heuristikou, což výrazně zvyšuje kvalitu výsledných aligmentů v porovnání s DIALIGN 2.2 a DIALIGN T. Pro párové alignmenty používá algoritmus "řetězení fragmentů" (fragment chaining), který upřednostňuje řetězce lokálních alignmentů s nízkým skóre před jednotlivými fragmenty s vysokým skóre. Pro násobné alignmenty DIALIGN-TN používá vylepšený "hladový postup" (greedy procedure), který není tak citlivý na nepodstatné lokální podobnosti. . # other Descriptions of the dialign-tx-data package with a translation in cs: #